玉皇庙遗址位于遗址西端，玄武山之西，远离城址，在两山脉交界处突出的高地上，地势险要。作为道教寺观使用至20世纪初，历史上曾为哨台。现存12米的石砌台基一座，高出地面约5米。台基周围有院落遗存。遗址附近有古树三株，分别为水杉、枫香，为土司时代遗迹。玉皇庙遗址附近有水井遗迹三处。
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